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重庆这边，秦良玉接手了四万大军的指挥权，与围困重庆的樊龙、张彤二人的两万精兵在重庆城外杀的是昏天暗地。

原本从军的土兵是没有什么军饷可言的，所以他们士气低落，而大明本地官军因为久疏战阵，同样是毫无战力可言。使得刚开始接手大军的秦良玉始终无法击破兵力只有自己一半的叛军。

随着沿长江而来的运输粮饷的船队抵达，秦良玉大手一挥，不管土兵还是官兵，一人二十两银子。同时，又斩杀了贪墨军饷的参将三人，四万明军士气大震，如出山的猛虎般朝着叛军冲去，用时两日就攻破了叛军大营，逼得叛军万余人跑回了佛图关。

不是他们不想跑，而是他们的后路已经被四川总兵李维新、监军副使李品仙、佥事监军刘可训率领的川军八千余人堵住了退路。

经过一番苦战，天启二年元月，四万多名明军终于攻破了佛图关的城墙，叛军首领樊龙、张彤以下四千余人战死，五千余人投降。不待休整的明军，沿长江快速进军。

元月末，明军光复了泸州城，彻底堵住了从成都逃难而来的奢崇明父子及其三万余残兵的归路。

当二月中旬，逃难而来的奢崇明父子发现泸州城已经被明军攻占，已经是惊弓之鸟的父子二人二话不说，带着大军往西边的叙州府逃去。

而此时的泸州城内只有秦良玉率领的五千酉阳土司兵驻守，其余的数万大军早已经分兵多路光复其他州府去了，所以她并没有第一时间派兵追击奢崇明父子。

二月末，杜文焕率领着三万川军精锐抵达泸州，在稍作休整，补充了粮草之后，大军往叙州府赶去，沿途继续光复被叛军攻占的城池。

得到捷报的朱燮元刚想松口气，没成想，西南局势变得更加糜烂了。

被奢崇明蛊惑的贵州水西土司同知安邦彦在天启二年二月份起兵犯黔，随后的数月间，与之交好的数个宣慰司、宣抚司纷纷起兵造反。

刚消灭了将近十万叛军的朱燮元发现，如今的叛军兵力直达二十万余。兵势更强于之前，呈越剿越多的趋势了。

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