“膜蛋白的功能往往受微环境影响。”陆小路解释道,“同一个蛋白在平坦膜区域和曲率高的区域构象可能不同,与邻近蛋白的相互作用也会改变其可及性。我们设计的K因子最终要在真实的肿瘤环境中工作,所以这些信息很

重要。”

通过与陆小路的交流,格里芬觉得这个年轻人的水平应该是世界顶级的,但是同为肿瘤学方面的专家,格里芬以前怎么对陆小路毫无印象,甚至他几次来中国参加学术会,居然没有听过陆小路的报告,不应该呀。

格里芬看了陆小路一眼:“你也是从事肿瘤研究的,为什么我以前没有拜读到你的论文,我与中国学者也有过交流,以前怎么从未听说过你的名字,不应该呀。”

陆小路一言难尽:“我也是来三博研究所才略有成果,以前嘛......”他没有再说下去,实验室里安静了片刻。

“抱歉。”格里芬说。

他意识到陆小路有难言之隐,或许他是大器晚成的人才,以前没有什么成果。

两人休息一会,结束闲聊,陆小路重新将注意力转回屏幕,启动了三维重构程序。成千上万的二维投影图像开始被计算、对齐、叠加,逐渐构建出细胞局部区域的三维模型。

时间一分一秒过去,凌晨两点,初步的三维重构完成。

屏幕上,一个令人惊叹的微观世界展现在眼前:癌细胞的质膜不是光滑的平面,而是布满了起伏、凹陷和突起。在这些动态的膜结构中,PANC-ID1复合物像一个个微小的锁具镶嵌其中。

陆小路放大其中一个复合物,在目前的分辨率下,能看出它由三个主要亚基组成:一个横跨膜的核心,一个较大的胞外结构域,以及一个较小的、形状不规则的附属蛋白

“这个小的应该就是你发现的未知蛋白。”格里芬指着那个不规则的模块,“它似乎通过柔性连接与核心相连,像是在膜表面摆动。”

“这可能是调控机制。”陆小路若有所思,“如果这个附属蛋白的构象可变,那么锁的开合状态也许可以调节。K因子要起作用,可能需要稳定在开启状态。”

就在两人专注分析时,实验室的门被轻轻推开。

张林探头进来,看到有人,愣了一下:“陆博士,格里芬医生,你们还在啊?”

“你又来干什么?”陆小路问。

“我......我睡不着,起来溜达看到这个实验室亮着灯,我以后谁下班没关灯呢。”张林不好意思地挠头,“既然这里开着灯,白天那个呼吸实验的数据,我用新学的机器学习方法重新分析了,发现了一个有趣的相关性,想用大

屏幕看看 。

“你睡在实验室?”陆小路很是奇怪。

张林点点头:“我和小五都睡在实验室,做实验不睡在实验室怎么行,笨鸟先飞嘛。”

陆小路不免心生一丝敬佩,他们还挺认真的,不是说着玩玩。

“什么相关性?”陆小路问道。

“手部姿势改变时,不只是呼吸模式变化,心率变异性也有同步改变。”张林走进来,打开自己的笔记本电脑,“你们看,这是拇指食指捏合时的频域分析,低频功率增加,高频功率减少,这是交感神经活性相对增强的表现。

而拇指无名指捏合时,情况正好相反??更像是副交感神经激活的模式。”

陆小路格里芬对视一眼,这确实超出了简单的“注意力转移”解释。

“你的意思是,特定手势能直接调节自主神经平衡?”陆小路严肃起来。

“数据暗示这种可能性,但我不确定机制。”张林说,“也许是通过某种尚未明确的体感-自主神经反射,或者......等等,你们在看什么?”

他的注意力被主屏幕上的三维结构模型吸引:“这是胰腺癌的那个靶点?哇,这么清楚!”

“初步模型,分辨率还很低。”陆小路说。

张林凑近屏幕,仔细看了半晌,突然说:“这个摆动的小蛋白......它表面是不是有一些正电荷富集区域?”

陆小路一怔:“你怎么看出来的?现在的分辨率看不出电荷分布。”

“不是看出来的,是猜的。”张林指了指结构模型上几个略微凸起的区域,“你看这些地方,在三维空间里形成了一种凹陷-凸起-凹陷的模式。如果我是自然进化出的锁,要和其他分子特异性结合,很可能会利用电荷互补,正

负电荷相吸是最简单直接的相互作用之一。”

格里芬若有所思:“用计算化学方法可以预测表面静电势,教授,要不我们试试?”

陆小路点头,调出另一个程序,基于已有的低分辨率结构,他用AlphaFold2预测了复合物的全原子模型,然后计算了表面静电势分布。

结果令人惊讶,正如张林猜测的那样,那个摆动的小蛋白表面,确实有三个明显的正电荷富集区,呈三角形排列。

“这很可能就是结合界面。”陆小路声音里带着兴奋,“如果K因子要识别这个靶点,它的结合表面应该有相应的负电荷互补区域,你特闷挺能猜的。”

张林嘿嘿笑了:“看来我这不务正业的观察力偶尔还有点用嘛。”

陆小路拍拍他的肩:“科学发现有时就需要不同角度的眼光,对了,你那个手势影响自主神经的发现,也许可以从神经解剖学找找解释。手掌和手指有丰富的机械感受器和本体感受器,它们的传入神经在脊髓和脑干有广泛的

投射,理论上确实可能影响自主神经核团。”

“真的?”张林眼睛亮了,“博士,你能指导我看些文献吗?”

“明天吧,现在太晚了。”陆小路看了眼时间,已经凌晨三点,“大家都回去休息吧。”

格里芬这时说:“你要是有需要,我可以介绍美国那边的神经学方面的专家给你。”

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